新疆建设军团当然不是军事组织,不过所施行的却是严格的军事户口制,但凡加入新疆建设兵团的户籍,都必须由朝廷组织起来,编入各户所,每十户为小旗,设小旗长,每五十户为一总旗,设总旗官,每百户为百户所,设百户官,每千户为千户所,设千户官,各个小旗、总旗、千户、百户的聚居点也是有规制的,譬如相隔百里安置一百户所,而该百户所的四周可以让一些小旗、总旗在百里之内分布,而方圆五百里设千户所,方圆五千里设万户所,在西伯利亚的中部,则准备建设一座城池,取名塞北,新疆建设兵团镇抚司便设与此。
每户人家可分得土地方圆一倾,任其放牧或者农耕,此外,朝廷每年按人丁编制发放俸禄,每人每月纹银一两,虽然不多,可是再加上分发的土地收入亦不算少了。
随着西伯利亚的顺利占领,关内各府各县的移民也纷纷的迁徙过来,人口约十四万户,人丁五十六万,新城里的新疆建设兵团镇抚司衙门忙的手脚不停,这人员的分配,聚居点的安置,还有铁路的路线、新城的建造以及各户土地的丈量,千头万绪都要等着处理,若不是朝廷抽调了不少皇家学院的学生前来协助,恐怕衙门里这么点人,要全部梳理干净了还不知道要等到何年何月去。